未払い賃金の清算について実態と一般的な対応方法を知りたい

◯事案の概要

上場準備中の労務監査によって未払い賃金が発覚し、過去3年に遡って清算する必要があるため、影響範囲や一般的な対応方法を知りたい。

◯相談内容

上場準備中の労務監査によって未払い賃金が発覚し、過去3年に遡って清算する必要があります。具体的にはどのように各人へ支払うのか、一般的な方法をお聞きできますでしょうか。

社会保険料について年金事務所に問い合わせたところ、「未払い賃金の清算」ということであれば、未払い賃金の計算対象期間に遡って、算定基礎届、月額変更届に該当するのであれば、修正申告をするように言われました。社会保険料の等級が変わってきますと、その月以降の社会保険料が全部変わってきますので、かなり大変な作業になるかと思います。

労働保険については、労働局には未確認ですが、過去に遡って修正申告をするにしても、年度で賃金総額で申告しますので、各人への影響は少なくて済むかと思っております。

以下、ご相談事項となります。

①税金については、専門外ですので未確認ですが、未払い賃金の清算があった場合は、対象年度に遡って、年末調整などのやり直しが必要となるのでしょうか?もしそうだとすると、人によっては、児童手当、子どもの医療費助成、保育所の料金、大学生の奨学金など様々な給付金やサービスの返納などの影響が出てくる、ということになるでしょうか。

②管轄行政から見た「正しい方法」は上記の通り、対象年度に遡って修正申告、ということになるかもしれませんが、一般的に、上場準備の過程で出てきた未払い賃金の清算は、どのような形で支払っているケースが多いでしょうか?過去の分であったとしても、今年度の賞与に上乗せして支払ってしまうと、手っ取り早いような気がしますが。

③人によっては、過去3年分の未払い残業代となりますと、数百万(最高は530万円)となるようです。もし今年度の所得として一括で支払ってしまいますと、年収が大幅に上がってしまい、税金や各種給付金などへの影響が懸念されます。会社として一括で支払うための資金的な問題は無いようですが、本人の希望を聞き、今後数年に渡って分割して支払う、というのは、上場審査においては有りでしょうか。清算を完了させないと、次には進めないのでしょうか?

以上、一般的なケースをお聞きできれば幸いです。

本当にどうするか、は、実際に審査を担当されているところに確認していただくようにしますが、参考までにほかの企業ではどうしているのか、というところがございましたらお聞きできれば幸いです。こんなに未払い残業が出てくるようでは、そもそも上場するのは難しいのでは?と思ってしまったりするのですが。

◯菰田弁護士の回答

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